W ustawie budżetowej na 2012 rok zapisano dla IPN (w części urzędów naczelnych organów władzy państwowej, kontroli i ochrony prawa oraz sądownictwa i sądów powszechnych) budżet w wysokości 259.521 tys zł.
Jest to budżet wyższy o 16,2% wobec roku ubiegłego (budżet IPN na 2011 wynosił 223.263 tys. zł). Niezależnie od tego budżetu, IPN, jak każda placówka prowadząca badania, może ubiegać się o granty badawcze z budżetu nauki.
Dla porównania podajemy także dotacje z budżetu wybranych jednostek:
Ośrodek Studiów Wschodnich im. Marka Karpia – 8 823
PISM – 9 102
CBOS – 3 202 (dotacja podmiotowa)
IMGW – 20 620 (dotacja celowa)
KSAP – 8 920 (dotacja podmiotowa)
FSNT – 19 300 (dotacja celowa)
PAP – 3 100